Устанавливать по-верх версии ниже патча.
Имя патча в архиве: cs16patch_full_v35.exe

После установки появляется меню Steam. Это незначит что патч для Steam версии. Патч NonSteam.
Для запуска Counter-Strike пользуйтесь ярлыком созданным на рабочем столе после установки, или добавьте к своему ярлыку директиву -steam .